Toàn cảnh 10 chính sách thuế mới có hiệu lực từ 1/6/2025
Tác giả: Lexconsult -
boxTư vấn nội dung
Tư vấn pháp lý cho doanh nghiệp
Võ Thị Thủy | Katie Vo (Mrs)
Luật Sư - info@lexconsult.com.vn
Xem thông tin

Từ ngày 01/6/2025, loạt chính sách thuế mới theo Nghị quyết 198/2025/QH15 chính thức có hiệu lực, mang đến nhiều thay đổi mang tính bước ngoặt cho cộng đồng doanh nghiệp và hộ kinh doanh. Đây không chỉ là một đợt cải cách thuế – phí thông thường, mà là chiến lược hỗ trợ dài hạn của Nhà nước nhằm thúc đẩy đổi mới sáng tạo, giảm chi phí vận hành và nâng cao tính minh bạch trong hoạt động tài chính.

Nếu doanh nghiệp của bạn đang hoạt động trong lĩnh vực khởi nghiệp, sản xuất, công nghệ hoặc thuộc nhóm doanh nghiệp nhỏ và vừa (SMEs), thì việc nắm rõ 10 chính sách thuế mới nổi bật năm 2025 dưới đây sẽ là chìa khóa giúp bạn tận dụng tối đa ưu đãi và đảm bảo tuân thủ pháp luật một cách hiệu quả.

Bài viết dưới đây sẽ giúp bạn hệ thống rõ 10 chính sách nổi bật theo Nghị quyết 198/2025, cùng những phân tích ngắn gọn, dễ hiểu để doanh nghiệp hiểu đúng – áp dụng trúng – tận dụng tối đa lợi ích từ các quy định mới.

Từ ngày 01/6/2025, loạt chính sách thuế mới theo Nghị quyết 198/2025/QH15 chính thức có hiệu lực, mang đến nhiều thay đổi mang tính bước ngoặt cho cộng đồng doanh nghiệp và hộ kinh doanh. Đây không chỉ là một đợt cải cách thuế - phí thông thường, mà là chiến lược hỗ trợ dài hạn của Nhà nước nhằm thúc đẩy đổi mới sáng tạo, giảm chi phí vận hành và nâng cao tính minh bạch trong hoạt động tài chính.
Việc hiểu và triển khai đúng các chính sách thuế mới không chỉ giúp doanh nghiệp tiết giảm chi phí, mà còn thể hiện sự chuyên nghiệp trong quản trị tài chính và tuân thủ pháp lý.

1. Miễn, giảm thuế thu nhập doanh nghiệp cho doanh nghiệp khởi nghiệp sáng tạo

Căn cứ: Khoản 1, Điều 10 Nghị quyết 198/2025/QH15

Doanh nghiệp hoạt động trong lĩnh vực đổi mới sáng tạo sẽ được:

– Miễn 100% thuế thu nhập doanh nghiệp (TNDN) trong 2 năm đầu;

– Giảm 50% thuế TNDN trong 4 năm tiếp theo cho phần thu nhập từ hoạt động khởi nghiệp sáng tạo.

Áp dụng cho: Doanh nghiệp khởi nghiệp đổi mới sáng tạo (theo Nghị định 80/2021/NĐ-CP).

Chính sách này giúp giảm áp lực tài chính đáng kể cho startup đang ở giai đoạn “đốt tiền”. Tuy nhiên, để được áp dụng, doanh nghiệp phải chứng minh rõ tính đổi mới sáng tạo về công nghệ, mô hình kinh doanh, sản phẩm. Doanh nghiệp cần:

– Phải phân định thu nhập từ hoạt động sáng tạo rõ ràng trong báo cáo tài chính;

– Có tài liệu chứng minh yếu tố “đổi mới sáng tạo” (sáng chế, phần mềm, công nghệ độc quyền…).

2. Nhà đầu tư vào startup được miễn thuế

Căn cứ: Khoản 2, Điều 10, Nghị quyết 198/2025/QH15

Miễn thuế TNCN và TNDN cho các khoản thu nhập phát sinh từ:

– Chuyển nhượng cổ phần;

– Góp vốn;

– Quyền góp vốn hoặc quyền mua cổ phần vào các doanh nghiệp khởi nghiệp sáng tạo.

→ Được miễn toàn bộ thuế TNCN và TNDN

Chính sách này giúp thúc đẩy đầu tư mạo hiểm trong nước, đặc biệt là các nhà đầu tư cá nhân, quỹ đầu tư thiên thần. Tuy nhiên, cần lưu ý rằng startup nhận vốn phải là doanh nghiệp hợp lệ theo quy định pháp luật để nhà đầu tư được miễn thuế.

Lưu ý cho doanh nghiệp:

– Cần chuẩn bị hồ sơ định danh là startup sáng tạo;

– Hợp đồng góp vốn, chuyển nhượng cần có điều khoản rõ ràng về mục đích đầu tư và lĩnh vực khởi nghiệp;

– Tránh đầu tư vòng qua nhiều lớp công ty trung gian vì có thể mất quyền hưởng ưu đãi.

3. Miễn thuế TNCN 2 năm cho chuyên gia, nhà khoa học làm việc tại startup

Căn cứ: Khoản 3, Điều 10, Nghị quyết 198/2025/QH15

Các chuyên gia, nhà khoa học có thu nhập từ hoạt động tại doanh nghiệp khởi nghiệp sáng tạo sẽ được:

– Miễn thuế TNCN trong 2 năm đầu;

– Giảm 50% trong 4 năm tiếp theo cho thu nhập từ tiền lương, tiền công.

Chính sách này tạo sức hút lớn đối với nguồn nhân lực trình độ cao, giúp startup thu hút chuyên gia giỏi trong các lĩnh vực công nghệ, nghiên cứu sản phẩm.

Lưu ý cho doanh nghiệp:

– Doanh nghiệp nên chủ động đăng ký chính sách ưu đãi cho từng nhân sự cụ thể;

– Cần lưu trữ hợp đồng lao động, bảng lương, và báo cáo hoạt động R&D rõ ràng.

4. Miễn thuế thu nhập doanh nghiệp trong 3 năm cho doanh nghiệp nhỏ và vừa

Căn cứ: Khoản 4, Điều 10 Nghị quyết 198/2025/QH15

Doanh nghiệp nhỏ và vừa (DNNVV) thành lập mới được: Miễn 100% thuế thu nhập doanh nghiệp trong 3 năm đầu kể từ ngày đăng ký kinh doanh.

Đây là chính sách hỗ trợ thiết thực, giúp DNNVV giảm áp lực tài chính, ổn định dòng tiền trong giai đoạn đầu hoạt động.

Doanh nghiệp cần lưu ý:

– Đối chiếu quy mô (doanh thu, số lao động) theo Luật Hỗ trợ DNNVV;

– Không nên “tranh thủ” thành lập công ty con để hưởng lặp ưu đãi (dễ bị truy thu thuế).

5. Được tính chi phí đào tạo cho DNNVV vào chi phí hợp lý

Căn cứ pháp lý: Khoản 5, Điều 10 Nghị quyết 198/2025/QH15

Doanh nghiệp lớn hỗ trợ DNNVV trong chuỗi cung ứng sẽ được tính chi phí đào tạo – đào tạo lại nhân lực vào chi phí được trừ khi xác định thuế TNDN.

Chính sách khuyến khích doanh nghiệp lớn “kéo DNNVV cùng phát triển” thông qua chia sẻ nhân sự, kỹ năng, công nghệ, tạo động lực cho mô hình hợp tác – cùng phát triển trong cộng đồng doanh nghiệp.

Doanh nghiệp nên thực hiện:

– Ký hợp đồng hỗ trợ đào tạo cụ thể với DNNVV;

– Có hóa đơn, tài liệu giảng dạy và báo cáo đào tạo thực tế.

Doanh nghiệp lớn khi thực hiện liên kết với doanh nghiệp nhỏ và vừa sẽ được tính chi phí đào tạo nhân lực (bao gồm cả đào tạo lại) cho doanh nghiệp nhỏ vào chi phí được trừ khi xác định thu nhập chịu thuế TNDN.

Lưu ý: Phải có kế hoạch hợp tác, chứng từ chi phí hợp lệ, nội dung đào tạo cụ thể và liên quan đến năng lực sản xuất, kinh doanh của doanh nghiệp nhỏ.

6. Chính thức bỏ phương pháp khoán thuế từ 01/01/2026

Căn cứ: Khoản 6, Điều 10, Nghị quyết 198/2025/QH15

Từ ngày 01/01/2026, phương pháp tính thuế khoán sẽ không còn được áp dụng cho hộ kinh doanh và cá nhân kinh doanh. Bỏ thuế khoán là bước ngoặt lớn trong cải cách thuế, thúc đẩy chuyển đổi mô hình hộ kinh doanh sang hình thức doanh nghiệp, tăng tính minh bạch, công khai và hiện đại hóa hệ thống thuế.

Tác động thực tế:

– Hộ kinh doanh phải thực hiện ghi sổ kế toán, kê khai thuế định kỳ, xuất hóa đơn điện tử;

– Mở đường cho việc tiếp cận tín dụng, vốn đầu tư và thị trường minh bạch hơn.

Lưu ý thực hiện:

– Doanh nghiệp nên chuẩn bị sớm về hệ thống hóa đơn điện tử và phần mềm kế toán;

– Cần được tư vấn về nghĩa vụ thuế mới theo mô hình doanh nghiệp để tránh rủi ro bị xử phạt.

7. Miễn lệ phí môn bài cho hộ kinh doanh từ năm 2026

Căn cứ: Khoản 7, Điều 10 Nghị quyết 198/2025/QH15

Từ năm 2026, hộ kinh doanh, cá nhân kinh doanh không còn phải nộp lệ phí môn bài.

Tác động tích cực:

– Giảm chi phí hành chính thường niên cho hộ kinh doanh

– Tạo điều kiện thuận lợi để hộ kinh doanh chuyển đổi sang doanh nghiệp trong bối cảnh áp dụng kê khai thuế và hóa đơn điện tử

Các hộ kinh doanh nên tận dụng thời gian từ nay đến cuối năm 2025 để chuẩn hóa hồ sơ, chuyển đổi mô hình hoạt động nhằm thích ứng kịp với các quy định mới có hiệu lực từ 2026.

8. Miễn phí cấp lại giấy tờ khi tổ chức lại bộ máy nhà nước

Căn cứ: Khoản 7, Điều 10 Nghị quyết 198/2025/QH15

Các tổ chức, doanh nghiệp, cá nhân sẽ được miễn toàn bộ lệ phí và thu phí khi thực hiện cấp lại hoặc cấp đổi các loại giấy tờ liên quan trong quá trình sắp xếp lại tổ chức bộ máy hành chính nhà nước.

Ý nghĩa thực tiễn:

– Hỗ trợ các doanh nghiệp, cơ quan Nhà nước khi thực hiện chuyển đổi mô hình, sáp nhập hoặc chia tách tổ chức;

– Giảm bớt gánh nặng chi phí trong quá trình tổ chức lại hệ thống, đặc biệt trong khối doanh nghiệp có vốn nhà nước.

Lưu ý áp dụng:

– Các đơn vị nên lưu trữ kỹ hồ sơ pháp lý để chủ động trong việc thực hiện thủ tục miễn phí;

– Có thể kết hợp tái cấu trúc bộ máy doanh nghiệp cùng thời điểm để tối ưu quy trình cấp lại giấy tờ.

9. Được trích lập quỹ phát triển khoa học – công nghệ tối đa 20% thu nhập tính thuế

Căn cứ: Khoản 1, Điều 12 – Nghị quyết 198/2025/QH15

Doanh nghiệp được trích tối đa 20% thu nhập tính thuế TNDN mỗi năm để thành lập quỹ phát triển khoa học và công nghệ (R&D).

Đây là chính sách khuyến khích doanh nghiệp đầu tư dài hạn vào đổi mới sáng tạo, nâng cao năng lực cạnh tranh, thúc đẩy nội lực công nghệ nội sinh.

Tác động đến doanh nghiệp:

– Tăng chi phí được trừ → giảm số thuế phải nộp;

– Có nguồn tài chính riêng cho hoạt động nghiên cứu, chuyển đổi số, phát triển sản phẩm mới.

Điều kiện áp dụng:

– Quỹ phải được thành lập, quản lý minh bạch theo quy định;

– Sử dụng đúng mục đích R&D; nếu chi sai mục đích, khoản này sẽ bị truy thu và phạt thuế.

10. Hạch toán gấp đôi chi phí R&D vào chi phí được trừ khi tính thuế TNDN

Căn cứ: Khoản 2, Điều 12 – Nghị quyết 198/2025/QH15

Chi phí thực tế doanh nghiệp bỏ ra cho hoạt động R&D được tính gấp đôi vào chi phí hợp lý khi xác định thu nhập chịu thuế TNDN. Nếu doanh nghiệp chi 1 tỷ đồng cho R&D → được tính 2 tỷ đồng vào chi phí hợp lý → giảm mạnh lợi nhuận chịu thuế → tiết kiệm hàng trăm triệu tiền thuế.

Gợi ý triển khai:

– Doanh nghiệp nên lập kế hoạch chi tiết cho các dự án R&D;

– Có hợp đồng, hóa đơn, chứng từ rõ ràng để chứng minh hoạt động R&D thực tế;

– Đưa R&D vào chiến lược phát triển trung – dài hạn để tận dụng tối đa chính sách này.

Lưu ý thực hiện:

– Chi phí R&D phải đáp ứng điều kiện tại Luật Thuế TNDN và hướng dẫn từ Bộ Tài chính;

– Không áp dụng cho chi phí vận hành thường xuyên hoặc chi phí marketing, bán hàng.

Như vậy, với các thay đổi trên thì việc hiểu và triển khai đúng các chính sách thuế mới không chỉ giúp doanh nghiệp tiết giảm chi phí, mà còn thể hiện sự chuyên nghiệp trong quản trị tài chính và tuân thủ pháp lý.

Nghị quyết 198/2025/QH15 là lời cam kết mạnh mẽ của Chính phủ trong việc đồng hành cùng khu vực tư nhân phát triển bền vững – từ hỗ trợ khởi nghiệp, miễn giảm thuế, đến thúc đẩy nghiên cứu và chuyển đổi số. Đây là thời điểm thích hợp để doanh nghiệp rà soát toàn bộ chiến lược thuế – kế toán, tối ưu chi phí hợp pháp và chủ động thích ứng với các yêu cầu mới. Đừng để vuột mất những ưu đãi đáng giá chỉ vì thiếu thông tin cập nhật.

Liên hệ đội ngũ luật sư tài chính – thuế của Lexconsult & Partners để được tư vấn chi tiết, đồng hành cùng doanh nghiệp bạn tận dụng hiệu quả chính sách thuế mới 2025 và nâng cao năng lực cạnh tranh trong giai đoạn chuyển đổi.

**Bài viết liên quan:**

– [Giao dịch dưới 5 triệu đồng có cần chuyển khoản? Điều kiện khấu trừ thuế GTGT mới 2025]

– [Luật Thuế tiêu thụ đặc biệt (sửa đổi) 2025: Tác động & giải pháp cho doanh nghiệp]

– [Thuế nhà thầu (FCT) 2025: Doanh nghiệp cần biết gì để tránh rủi ro và tiết kiệm chi phí]

 

 

 

 

Công ty Luật TNHH Lexconsult & Cộng sự
Địa chỉ: Tầng 9, Tòa nhà Diamond Plaza, 34 Lê Duẩn, phường Sài Gòn, Tp. Hồ Chí Minh
Điện thoại: 0938 657 775
Email: lawyers@lexconsult.com.vn
Website: www.lexconsult.com.vn – www.lexconsult.vn